J.C. Jacobsen havde i sit testamente bestemt, at huset efter hans og hans nærmestes død, skulle benyttes som æresbolig for en fortjent mand eller kvinde inden for videnskab, litteratur eller kunst. Den første beboer var filosoffen Harald Høffding. Han afløstes af atomfysikeren Niels Bohr, der beboede huset fra 1931-1962. Huset sidste beboer var sinologen Søren Egerod i 1988-1995. Tiden var nu løbet fra æresboliger, og derfor besluttede Carlsbergfondet, at omdanne huset til Carlsberg Akademi. Villaen blev gennemrenoveret af arkitekt Runa Lyshøj. Havestuen blev ført tilbage til sit oprindelige udseende fra 1866, og spisestuen fik reetableret sit ovenlys. Første sal blev indrettet til gæstebolig for en udenlandsk forsker.